Дорогой пользователь! Мы рады представить новую платформу PSSKB. Её целью является интеграция знаний о белке.

Наша команда накопила много практического опыта в области омиксных наук, что побудило нас создать и развивать платформу PSSKB. Вопросы интеграции существующих знаний о белках и новых знаний, полученных при изучении патологий (напр. об аберрантных формах белков, а также DEP), вопросы интеграции маркеров-кандидатов белкового происхождения в сигнальные пути (PPI) и вопросы изменений в  функциях белка за счет эпигенетических (ПТМ) и генетических (SNP) изменений требуют понимания структуры белка и границ «нормальности» содержания тех или иных изменений согласно парадигме структурной биологии.

Проблемы интерпретации результатов «сырых» экспериментов, в первую очередь масс-спектрометрических данных, заставили задуматься о важности создания и популяризации инструментов и сервисов структурной биологии.

Мы инициировали проект PSSKB, направленный на создание диверсифицированных сервисов на единой платформе для проведения экспериментов с использованием инструментов структурной биологии:

• поиск и идентификация сходных белковых структур,
• отображение структурных мотивов,
• аннотирование белковых структур,
  
• выполнение расчетов молекулярной динамики на интактных структурах и белках с заменой ПТМ/аминокислоты.

Наша платформа создана в первую очередь для биохимиков и молекулярных биологов и не требует специальных навыков и знаний для проведения исследований. Также она моджет быть полезна для студентов, специализирующихся в области биомедицины. Все расчеты выполняются на базе платформы PSSKB.